将取消工本费和签注费的，是外事部门签发的《往来香港澳门特别行政区通行证》（左），而不是由公安出入境管理部门签发的《往来港澳通行证》。
因公港澳通行证工本费签注费、户口簿工本费等30项收费将取消或免征
昨日，记者从中华人民共和国财政部官方网站了解到，2013年1月1日起，办理《往来香港澳门特别行政区通行证》的工本费和签注费将不再收取。不过需要注意的是，《往来香港澳门特别行政区通行证》与市民平时使用的港澳通行证并非同一证件，也就是说市民因私办理的港澳通行证工本费和签注费仍要“自掏腰包”。
昨日, 中华人民共和国财政部在其网站发布通知，自2013年1月1日起，将取消和免征30项行政事业性收费，其中就包括《往来香港澳门特别行政区通行证》工本费和签注费，获得减免的还有《派驻香港澳门身份证明》工本费。
此外，因公护照费（含加急费）、户口簿工本费（不含因丢失、损坏补办户口簿收取的工本费）和户口迁移证和准迁证工本费（不含因丢失、损坏补办和因过期失效重办户口迁移证、准迁证收取的工本费）也被纳入15项免征的行政事业性收费项目之中。
财政部宣布取消港澳通行证的工本费和签注费时，不少市民误会港澳通行证不用收费。不过，据广州市公安局出入境管理处在其官方微博指出：此次取消行政收费的是外事部门签发的因公护照费（含加急费）、《往来香港澳门特别行政区通行证》工本费及签注费。也就是说，《往来香港澳门特别行政区通行证》和《往来港澳通行证》是两本不同的证件，前者由外事部门签发，后者由公安出入境管理部门签发，并没有列入取消的行政事业性收费项目之中。